一、直接镜检采集病变部位标本以10%KOH制片或革兰氏染色，镜下观察，见有大量的球状出芽酵母菌型和假菌丝，为特征性发现。 二、活组织检查采取病变组织以进一步从组织病理学查找念珠菌侵袭的证据。如念珠菌食管炎的患者，在做内镜刷取标本检查后，加做做活检，可以进一步确诊，也可与其他病因(单纯疱疹病毒或巨细胞病毒)引起的食管炎相鉴别。