猴痘的潜伏期(从获得感染到出现症状的间隔时间)从6天至16天。可将感染分成两个阶段：
1.发病期(0～5天)
特点是发热、剧烈头痛、淋巴结肿大、背痛、肌肉痛(肌肉疼痛)以及倍感无力(精神不振)。
2.皮肤出疹期
此时处于不同阶段的皮疹几乎同时出现在脸上、手掌和脚掌上以及躯干部位。皮疹的变化从斑丘疹(底部扁平的病变)，一直到小水疱(充满液体的小疱)、脓疱，大约10天左右伴随而来的便是结痂。可能需要三周时间结痂才能完全消失。
病变的数量从少数几个到几千个，影响到口腔黏膜、生殖器以及结膜(眼皮)，还有角膜(眼球)。
有的患者在出现皮疹前，会发生严重的淋巴结病(淋巴结肿大)。淋巴结病的出现可能有助于识别猴痘，因为天花或者水痘都不具备这一特征。
猴痘症状通常持续14至21天。
猴痘疾病的症状并不多，早期与一般的皮肤病有相似，多数患者不能确诊疾病，从而延误疾病的治疗，患者长时间治疗无效时，就必须引起重视可到医院检查诊断疾病，而患者发现疾病的异常后，也要进行隔离治疗。
